НОВ БЪЛГАРСКИ УНИВЕРСИТЕТ
ул. Монтевидео 21, София, 1618
Център по дистанционно обучение
Р Е Ф Е Р А Т
ФИЗИКОХИМИЧЕН СТРОЕЖ НА ДНК И РНК
РЕПЛИЦИРАНЕ НА ДНК
Изготвен от:
Десислава Симеонова Лазарова,
Студентка в програма: Екология и околна среда, ДО
Курс:– Микробиология и микробиологични методи на пречистване
Преглед на молекулярната структура
Двойната спирала на ДНК е най- познатият символ на биологичната революция, започнала през 40-те години. На повърхността на двойната спирала релефно изпъкват очертанията на две нишки, завити една върху друга. Всяка нишка- дълъг полимер от субединици, наречени нуклеотиди- представляват верига, в която фосфатните групи се редуват със захар, дезоксирибоза. Веригите имат полярност или посока: в дуплекса те са разположени успоредно, но в противоположни посоки и са завити надясно.
Нуклеиновите киселини- ДНК и РНК, са високомолекулни съединения. ДНК предава наследствената информация, а РНК се включва в синтеза на белтъците. Изградени са от мономерни единици, наречени нуклеотиди. Нуклеотидите се състоят от три съставки- азотни бази, захар-пентоза и фосфатен остатък. Нуклиотидите се свързват в полинуклеотидни вериги.
Азотните бази са производни на две ароматни хетероциклени съединения пурин и пиримидин. В пуриновите бази влизат аденин (А) и гуанин (Г), а към пиримидиновите бази се отнасят тимин (Т), цитозин (Ц) и урацил (У).
ДНК се състои от захарта дезоксирибоза, фосфатен остатък, две пуринови бази аденин (А) и гуанин (Г) и две пиримидинови бази- тимин (Т) и цитозин (Ц). В молекулат на ДНК количеството на А е винаги равно на количеството на Т, а количеството на Г- на количеството на Ц.
ДНК съхранява и предава информацията за клетъчната програма. Подобно на архитектурния план на сграда ДНК съдържа пълна информация за устройството на клетката. Клетката има специални начини за разчитане на информацията. Информацията е записана под формата на кодони – три буквени измерения или това са три последователно подредени бази. АТЦ, ЦТГ. Участъкът от ДНК, който носи информация за синтеза на белтък или РНК се нарича ген. Генът е най-малката единица за наследственост. Наследствената програма се нарича още генетична програма. Как тази програма се запазва при деленето на клетката без да се промени. Тогава двойната спирала се разчупва и в новата клетка се синтезира по правилото А-Т Г-Ц. Нова двойна спирала. ДНК молекулата е стабилна – може да запази наследствената програма.
РНК съдържа вместо дезоксирибоза- рибоза и вместо тимин- урацил. Тя е едноверижна полинуклеотидна верига, съдържаща от 75 до 10 000 нуклеотида. Детерминант е на наследствеността при някои вируси, които съдържат само РНК.
Синтезата на РНК се осъществява върху една от веригите на ДНК, която служи като матрица с помощта на ензима РНК-полимераза. Синтезираната РНК е комплементарна на своята матрица ДНК по принципа на специфичното свързване на базите. Налице са три вида рибонуклеинова киселина- информационна (и) и рибозомна (р).
Информационната РНК или матричната РНК (мРНК) обуславя подреждането на аминокиселините в белтъчната молекула.
Информационните – презаписват информацията от ДНК, те могат да разчитат написаната върху ДНК. Транспортните РНК – приличат на сгънат на две детелинов лист – от едната страна могат да се свързват с аминокиселини, а от другата с информационната РНК. Те превеждат информацията от ДНК на езика на белтъците.
Информацията тече ДНК РНК Белтък.
ДНК носи информацията чрез кодони – информационните РНК презаписва кодоните, а транспортните РНК с помощта на актидони, които съответстват на кодоните намират мястото си.
Изграждане на белтъчната молекула.
Синтеза на белтъчната верига се осъществява в рибозомите. Представляват малки овални телца, неограничени с мембрана. Всяка клетка съдържа огромно количество рибозоми само така може да задоволи белтъчния глад на клетката.
Как се осъществява реализацията на генетичната информация.
Първи етап
Транскрипция – преписване.
Копирането на РНК на една от веригите на ДНК се нарича транскрипция.
Транскрипция. Синтез РНК на ДНК-матрицата;
Информацията на ДНК се намира в ядрото. За да бъде изнесена от там на помощ идва информационната РНК. РНК влиза в ядрото и разчита само тази част от информацията, която е нужна на клетката. Презаписването на информацията става с помощта на ензим, съгласно матричния принцип А-У и Т-Ц. Този етап се осъществява в клетъчното ядро.
При синтез на информационната РНК (иРНК) една от спиралите на ДНК действа като матрица, комплементарно (взаимнодопълващо) на която се създава РНК. Информацията се предава по тройки нуклеотиди (кодони).
Този код се използва при синтез на белтъци в клетъчната цитоплазма. Затова информационната РНК преминава през порите на ядрото в цитоплазмата, където се съединява с рибозомите. Техният структурен скелет е съставен от друг клас РНК – рибозомните РНК, Там пренесената информация се “разчита”.
ТРАНСКРИПЦИЯ
Втори етап
Транслация – предаване.
ТРАНСЛАЦИЯ
Нужно е тази генетична последователност да се превърне в полипептидна последователност. Как става това? Информационната РНК напуска ядрото , влиза в цитоплазмата и се свързва с рибозомите. Към нея се насочва транспортна РНК носеща със себе си точно определена аминокиселина. С помощта на антикодон тя намира мястото си върху информационната РНК и застава там. Така наредени една друга аминокиселините се свързват с пептидна връзка и образуват белтък. Всяка аминокиселина заема онова място от полипептидната верига, което е закодирано в молекулата на ДНК, преписано то молекулата ни иРНК и разпознато от съответната тРНК. За да става по компактно производството на белтъци една иРНК минава през много рибозоми. Така се образуват полирибозомни комплекси и съответно много полипептидни вериги, които веднага се поемат от клетъчните органели и отиват по предназначението си.
Молекулата на ДНК се състои от две комплементарни вериги навити спирално около предполагаема ос, модел на Wotson и Crik. Двете вериги са свързани с водородни връзки . Нуклеотидите са разположени така, че винаги срещу аденина стои тимин, а срещу гуанина- цитозин. Водородните връзки между аденина и тимина са двойни (А=Т), а между гуанина и цитозина- тройни (Г=ц). Комплементарната верига е единична ДНК верига. Тя се синтезира посредством използването на друга ДНК верига, която служи като матрица. Подреждането на базите на новата верига зависи от реда на базите в матричната верига по правилото А-Т, Г-Ц.
Матрична верига АА ТТ АГ ЦЦ ГА
ТТ АА ТЦ ГГ ЦТ
Пуриновите бази са равни на пиримидиновите. Секвенцията на базите от едната спирала напълно определя (детерминира) секвенцията на базите от другата спирала, която се явява реципрочна.
Молекулите на друг вид РНК – транспортната имат функцията да подбират съответните аминокиселини и да ги вграждат в строго определените им от антикодона места на “конвейра” за синтез на белтъци. Докато рибозомата се движи по направлението на информационната РНК, към нея се присъединява подходящата тройка молекули на тРНК, носеща определена аминокиселина. След това аминокиселините се освобождават от молекулите-носители и се съединяват една с друга в растящата пептидна верига от белтъци.
При нагряване на ДНК при висока температура (под 100°С) водородните връзки се разкъсват и двете вериги се разделят. Получава се едноверижна ДНК, която се нарича денатурирана. Температурата, при която се получава денатурирана ДНК се нарича температура на топене. При бавно охлаждане в солов разтвор двете вериги могат отново да се свържат чрез водородните връзки- получава се ренатурирана ДНК с всички необходими особености на ДНК, от която е получена денатурираната ДНК. Когато ДНК е получена чрез обединяване на два или повече участъка на ДНК, изолирани от различни източници, тя се нарича рекомбинантна ДНК.
Двойната водородна връзка между аденина и тимина е по- слаба от тройната връзка между гуанина и цитозина. При получаване на денатурираната ДНК чрез нагряване, първата връзка по- лесно се разкъсва от втората.
Ренатурираната ДНК може да се получи от единични вериги на ДНК от различни видове бактерии. В този случай се получава хибридна ренатурирана ДНК, която се различава от изходната ДНК на двата вида. При ренатурирането нишките на ДНК от различните видове не се свързват напълно.
Свързват се само тези участъци на двете вериги, които са комплементарни, при които срещу аденина стои тимин, а срещу гуанина- цитозин и обратно. Участъците, при които няма такава последователност на азотните бази, не се свързват и не се получава ренатурирана ДНК. От физикохимичния строеж на ДНК и по- точно от последователността на азотните бази зависи синтезирането на белтъчини в клетката.
Основна морфологична единица, която предава наследствена информация е генът . Той е участък от полинуклеотидната верига на ДНК и съдържа информация за биосинтеза на една белтъчна полипептидна верига.
Реплициране на ДНК (Удвояване на ДНК)
Биосинтеза на ДНК (репликация) е анаболитен процес. Спазва се правилото за съответност А – Т , Г – Ц
Репликацията се осъществява чрез разделяне на двете нишки чрез относително прости химически реакции и пресъздаване на „другата половина“ за всяка получена единична верига чрез потапяне на всяка верига в „супа“, която съдържа всичките четири бази. Тъй като всяка база може да се комбинира само с една от останалите бази, базите в съществуващите вериги определят какви бази ще има в новообразуваната верига. По този начин, всяка единична верига заедно с базите, които събира в „супата“, образува точно копие на оригиналната ДНК, освен ако не настъпи мутация. Репликацията е процес, при който се удвоява ДНК на клетката
Удвояване на ДНК може да стане по три начина – консервативен, дисперсионен и полуконсервативен .
При консервативния начин двойната спирала на ДНК не се разделя. Старата служи като матрица за синтезиране на нова двойна спирала. При този начин на удвояване в клетката трябва да има родителски (стари) и дъщерни (млади) молекули на ДНК. Новите дъщерни молекули се изграждат изцяло от нов материал, а старите остават непроменени и служат като матрица за образуване на дъщерни молекули.
При дисперсионния начин двойната верига се разделя на части. На местата на разделянето се включват нови участъци от ДНК. По този начин във веригата има нови и стари участъци.
При полуконсервативния начин двойната спирала се разделя и се образува към всяка единична верига нова, комплементарна на старата верига. При този начин новополучената двойноверижна спирала се състои от една стара (родителска) и от една нова (дъщерна) верига. Дъщерната верига се формира на матрицата на родителската.
Реплицирането на ДНК се извършва само по полуконсервативен начин. То започва от точно определена точка, означавана като origin С (хромозома). В разделянето на двете комплементарни вериги участие вземат специфични ензими, наречени хеликази.
Самото разделяне на веригата става на три етапа – инициация, елонгация и терминация. Едновременно с разделянето се образуват и нови двойни вериги на мястото, където е започнало разделянето, което служи като шарнир, двете новополучени вериги се завъртат на 180° и напълно се разделят.
Реплицирането на ДНК се отличава с голяма точност. Новополучените двойни спирали са напълно идентични със старите. Това осигурява точно предаване на наследствените белези.
ензими
Нуклеотиди + ДНК-матрица ДНК
(градивни моно-
мери +енергия)
Основен ензим на репликацията
ДНК- полимеразата – добавя нуклеотиди към свободния край на нарастващата полинуклеотидна верига, отстранява погрешни нуклеотиди, попълва “дупки” с липсващи нуклеотиди. Но не може да започне синтеза на ДНК.
Целият комплекс от ензими и белтъци, които участват в осъществяването на биосинтезата на ДНК, се нарича белтъчен комплекс на репликация. Процесите, които осигуряват допълнително точността на репликацията, се наричат поправка на ДНК